Es probable que encuentres dificultades con estas cuatro palabras (haya, halla, aya y allá). Ahora bien, si te fijas un poco, comprobarás que no todas se pronuncian de la misma manera: las tres primeras (haya, halla y aya) se pronuncian de forma llana ([áya]), mientras que la última (allá) se pronuncia de forma aguda ([ayá]), lo que tal vez te ayude de entrada a diferenciar algunas y escribirlas correctamente. En cualquier caso, explicaremos en [1] las que poseen una articulación llana mientras que en [2] la única que posee una articulación aguda:

[1] La diferencia entre haya / halla / aya:

1. Haya es una forma del verbo "haber", por lo que solo podremos encontrarla como auxiliar de una forma verbal compuesta (haya estudiado / haya comido / haya reído) o con el sentido de "exista" (puede que haya cuatro personas en la sala en este momento = puede que existan cuatro personas...). En el primer caso, además de que irá seguida de una forma de participio ("estudiado", "comido", "reído"), observa que es posible sustituir esta forma por otra cualquiera del verbo "haber" (aprobará quien haya estudiado = habrán estudiado).
2. Halla, por su parte, es una forma del verbo "hallar", que es sinónimo de "encontrar". Así, siempre que puedas sustituir "halla" por "encuentra", indudablemente se escribirá con doble ele. Por ej., halla (= encuentra) el valor de la equis en esta ecuación. [En este caso, "halla" se escribe con <ll> porque contiene <ll> en su infinitivo: hallar; sin embargo, la forma del verbo "haber", como aquí el infinitivo no contiene ninguna <ll>, se escribe con <y>. Esto es, cuando dudemos entre escribir <y> o <ll> en una forma verbal, fijémonos en el infinitivo: si este contiene <ll>, la forma verbal también contendrá <ll>; si no se utiliza este dígrafo, o se utiliza directamente <y>, la forma contendrá <y>.]
3. Aya es una palabra que hoy ya casi no se emplea, pero que es probable que todavía encuentres escrita en algún texto, especialmente de la Edad Media. La RAE define "ayo" o "aya" como la "persona encargada en las casas principales de custodiar niños o jóvenes y de cuidar de su crianza y educación", es decir, podemos entender que es un sinónimo de sirviente o de educador. (En un libro del siglo XIV que es muy probable que estudies en clase, que tiene por título El Conde Lucanor, aparece un personaje, Patronio, ayo del conde, que es su consejero.)

[2] Como hemos adelantado, allá es la única forma aguda del conjunto con el que puedes dudar ([ayá]), por lo que su pronunciación puede ayudarnos a la hora de escribirla correctamente (siguiendo este criterio, no resulta posible confundirla con el resto). Ahora bien, observa también que es un adverbio de lugar, por lo que hace referencia a un espacio geográfico más o menos alejado de la persona que emite el mensaje (pon tu vista allá). Por esta circunstancia, es posible sustituirlo por otro adverbio de lugar, como por ejemplo "allí" directamente, o cualquier otro (así, pon tu vista allí / ahí).